Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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