Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Tp53bp1P70399 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Tp53bp1P70399 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Tp53bp1P70399 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Tp53bp1P70399 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Tp53bp1P70399 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Tp53bp1P70399 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Tp53bp1P70399 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Tp53bp1P70399 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Tp53bp1P70399 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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