Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Gm16283-201ENSMUST00000149935 522 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Mir341-201ENSMUST00000093593 96 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp9xP70398 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Gstm3-201ENSMUST00000004136 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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Usp9xP70398 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Glrx2-206ENSMUST00000145969 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
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Usp9xP70398 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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Usp9xP70398 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp9xP70398 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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