Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbdsP70122 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbdsP70122 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SbdsP70122 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbdsP70122 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbdsP70122 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbdsP70122 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
SbdsP70122 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms