Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
UbdP63072 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
UbdP63072 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
UbdP63072 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
UbdP63072 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
UbdP63072 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
UbdP63072 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
UbdP63072 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
UbdP63072 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
UbdP63072 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
UbdP63072 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
UbdP63072 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
UbdP63072 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
UbdP63072 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
UbdP63072 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
UbdP63072 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
UbdP63072 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
UbdP63072 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
UbdP63072 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
UbdP63072 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
UbdP63072 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
UbdP63072 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
UbdP63072 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
UbdP63072 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
UbdP63072 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
UbdP63072 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
UbdP63072 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
UbdP63072 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
UbdP63072 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
UbdP63072 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
UbdP63072 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
UbdP63072 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
UbdP63072 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
UbdP63072 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
UbdP63072 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
UbdP63072 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
UbdP63072 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
UbdP63072 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
UbdP63072 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
UbdP63072 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
UbdP63072 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
UbdP63072 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
UbdP63072 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
UbdP63072 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
UbdP63072 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
UbdP63072 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
UbdP63072 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
UbdP63072 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
UbdP63072 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
UbdP63072 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
UbdP63072 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
UbdP63072 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
UbdP63072 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
UbdP63072 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
UbdP63072 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
UbdP63072 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
UbdP63072 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
UbdP63072 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
UbdP63072 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
UbdP63072 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
UbdP63072 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
UbdP63072 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
UbdP63072 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
UbdP63072 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
UbdP63072 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
UbdP63072 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
UbdP63072 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
UbdP63072 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
UbdP63072 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
UbdP63072 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
UbdP63072 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
UbdP63072 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
UbdP63072 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
UbdP63072 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
UbdP63072 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms