Protein–RNA interactions for Protein: P62821

Rab1A, Ras-related protein Rab-1A, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1AP62821 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.7 ms