Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

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Length 70 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Pfkfb3-216ENSMUST00000191668 2216 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Cacna1d-207ENSMUST00000224198 6564 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sem1P60897 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Urb1-203ENSMUST00000140920 7344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Slc22a13-201ENSMUST00000084797 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Slc26a1-202ENSMUST00000119270 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Slc26a1-204ENSMUST00000163328 3015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Amotl1-206ENSMUST00000223132 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Unc13d-203ENSMUST00000106451 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Unc13d-201ENSMUST00000075036 3967 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Rorb-202ENSMUST00000112828 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Gm20682-201ENSMUST00000176552 3517 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Sdc2-201ENSMUST00000022871 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Sept6-202ENSMUST00000060474 3457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Mfn2-201ENSMUST00000030884 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sem1P60897 D030047H15Rik-201ENSMUST00000148318 2536 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sem1P60897 AC154171.3-201ENSMUST00000224519 2505 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sem1P60897 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Olfr169-204ENSMUST00000216070 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Acot12-201ENSMUST00000022120 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Tada2a-201ENSMUST00000018795 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sem1P60897 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Zfp185-201ENSMUST00000114546 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Gcm1-201ENSMUST00000024104 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sem1P60897 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Pms2-209ENSMUST00000148011 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Dgcr2-201ENSMUST00000012152 4045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sem1P60897 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sem1P60897 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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Sem1P60897 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Zmpste24-201ENSMUST00000058754 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Enthd1-201ENSMUST00000096347 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sem1P60897 4930478P22Rik-203ENSMUST00000202026 2060 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Ptpn21-201ENSMUST00000085116 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Ggct-202ENSMUST00000131475 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Sfmbt1-204ENSMUST00000227303 2960 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Pde2a-212ENSMUST00000211368 3885 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Gm39244-201ENSMUST00000209663 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Pik3r4-210ENSMUST00000191268 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sem1P60897 0610030E20Rik-201ENSMUST00000077783 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Gpr156-201ENSMUST00000061274 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Sem1P60897 Slc12a5-209ENSMUST00000202623 3574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Gm37731-201ENSMUST00000194545 2237 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Cenpl-201ENSMUST00000028035 4883 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Gpm6b-206ENSMUST00000112228 3083 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Sem1P60897 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Bcas1-203ENSMUST00000109152 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Olfr1395-203ENSMUST00000214195 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Cacna1c-206ENSMUST00000185345 6579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sem1P60897 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Grik1-211ENSMUST00000228188 3221 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Gm37084-201ENSMUST00000191688 5898 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Gm10390-202ENSMUST00000181905 4269 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Zcchc8-201ENSMUST00000031376 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Tigd4-201ENSMUST00000062623 3459 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sem1P60897 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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