Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms