Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf5P56477 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf5P56477 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Irf5P56477 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf5P56477 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf5P56477 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf5P56477 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Olfr282-203ENSMUST00000213608 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Gm14435-201ENSMUST00000108995 643 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf5P56477 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Irf5P56477 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf5P56477 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf5P56477 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf5P56477 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf5P56477 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf5P56477 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf5P56477 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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