Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Sh3bp1P55194 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Sh3bp1P55194 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Sh3bp1P55194 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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Sh3bp1P55194 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Gm40655-201ENSMUST00000220802 1880 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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