Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Aqp4P55088 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms