Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgd1P52734 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgd1P52734 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fgd1P52734 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgd1P52734 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgd1P52734 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgd1P52734 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Fgd1P52734 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fgd1P52734 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgd1P52734 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgd1P52734 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fgd1P52734 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fgd1P52734 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Fgd1P52734 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fgd1P52734 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Fgd1P52734 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fgd1P52734 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Fgd1P52734 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgd1P52734 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgd1P52734 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgd1P52734 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgd1P52734 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Fgd1P52734 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgd1P52734 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgd1P52734 Cd300lg-202ENSMUST00000107163 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgd1P52734 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgd1P52734 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgd1P52734 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fgd1P52734 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fgd1P52734 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fgd1P52734 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fgd1P52734 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fgd1P52734 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fgd1P52734 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Fgd1P52734 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Fgd1P52734 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fgd1P52734 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fgd1P52734 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fgd1P52734 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fgd1P52734 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fgd1P52734 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fgd1P52734 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fgd1P52734 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fgd1P52734 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fgd1P52734 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fgd1P52734 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fgd1P52734 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Fgd1P52734 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fgd1P52734 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fgd1P52734 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fgd1P52734 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fgd1P52734 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fgd1P52734 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fgd1P52734 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fgd1P52734 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fgd1P52734 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fgd1P52734 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fgd1P52734 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fgd1P52734 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fgd1P52734 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fgd1P52734 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fgd1P52734 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fgd1P52734 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fgd1P52734 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fgd1P52734 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fgd1P52734 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fgd1P52734 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fgd1P52734 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fgd1P52734 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fgd1P52734 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fgd1P52734 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fgd1P52734 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fgd1P52734 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fgd1P52734 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Fgd1P52734 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fgd1P52734 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fgd1P52734 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fgd1P52734 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fgd1P52734 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fgd1P52734 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fgd1P52734 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fgd1P52734 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fgd1P52734 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Fgd1P52734 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fgd1P52734 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fgd1P52734 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fgd1P52734 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fgd1P52734 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Fgd1P52734 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fgd1P52734 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fgd1P52734 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Fgd1P52734 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fgd1P52734 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fgd1P52734 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fgd1P52734 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Fgd1P52734 Gal3st2-201ENSMUST00000094663 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fgd1P52734 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fgd1P52734 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fgd1P52734 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fgd1P52734 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms