Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcl5P50228 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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