Protein–RNA interactions for Protein: P49935

Ctsh, Pro-cathepsin H, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtshP49935 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CtshP49935 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CtshP49935 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CtshP49935 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtshP49935 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtshP49935 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtshP49935 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CtshP49935 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtshP49935 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtshP49935 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtshP49935 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtshP49935 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CtshP49935 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtshP49935 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtshP49935 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtshP49935 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtshP49935 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtshP49935 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtshP49935 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtshP49935 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CtshP49935 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtshP49935 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtshP49935 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtshP49935 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtshP49935 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtshP49935 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtshP49935 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtshP49935 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtshP49935 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtshP49935 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtshP49935 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtshP49935 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtshP49935 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CtshP49935 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtshP49935 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtshP49935 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtshP49935 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtshP49935 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtshP49935 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CtshP49935 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CtshP49935 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtshP49935 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtshP49935 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CtshP49935 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CtshP49935 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtshP49935 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtshP49935 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtshP49935 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtshP49935 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtshP49935 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CtshP49935 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtshP49935 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CtshP49935 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CtshP49935 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CtshP49935 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CtshP49935 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CtshP49935 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CtshP49935 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtshP49935 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CtshP49935 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtshP49935 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtshP49935 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtshP49935 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtshP49935 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtshP49935 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtshP49935 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtshP49935 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CtshP49935 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtshP49935 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CtshP49935 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtshP49935 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtshP49935 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtshP49935 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtshP49935 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtshP49935 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtshP49935 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtshP49935 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtshP49935 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtshP49935 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtshP49935 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtshP49935 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtshP49935 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtshP49935 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtshP49935 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CtshP49935 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtshP49935 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtshP49935 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtshP49935 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtshP49935 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtshP49935 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtshP49935 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtshP49935 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtshP49935 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtshP49935 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CtshP49935 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtshP49935 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CtshP49935 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CtshP49935 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtshP49935 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtshP49935 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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