Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VdrP48281 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VdrP48281 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VdrP48281 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VdrP48281 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VdrP48281 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VdrP48281 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VdrP48281 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VdrP48281 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VdrP48281 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VdrP48281 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VdrP48281 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VdrP48281 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VdrP48281 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
VdrP48281 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VdrP48281 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
VdrP48281 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
VdrP48281 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VdrP48281 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VdrP48281 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VdrP48281 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VdrP48281 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VdrP48281 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VdrP48281 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm16551-203ENSMUST00000160979 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VdrP48281 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VdrP48281 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VdrP48281 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VdrP48281 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VdrP48281 Apobec1-203ENSMUST00000112587 2072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VdrP48281 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VdrP48281 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VdrP48281 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VdrP48281 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VdrP48281 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VdrP48281 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VdrP48281 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VdrP48281 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
VdrP48281 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VdrP48281 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VdrP48281 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VdrP48281 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VdrP48281 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VdrP48281 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VdrP48281 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VdrP48281 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VdrP48281 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VdrP48281 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VdrP48281 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VdrP48281 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VdrP48281 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VdrP48281 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VdrP48281 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VdrP48281 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
VdrP48281 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VdrP48281 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VdrP48281 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VdrP48281 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VdrP48281 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VdrP48281 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VdrP48281 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VdrP48281 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VdrP48281 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VdrP48281 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VdrP48281 9430065F17Rik-203ENSMUST00000223845 1380 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
VdrP48281 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VdrP48281 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VdrP48281 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VdrP48281 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VdrP48281 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VdrP48281 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VdrP48281 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm9929-201ENSMUST00000171747 1671 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VdrP48281 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VdrP48281 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VdrP48281 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VdrP48281 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VdrP48281 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VdrP48281 Fxr1-202ENSMUST00000167354 1986 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms