Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrprbP47758 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrprbP47758 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SrprbP47758 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrprbP47758 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrprbP47758 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrprbP47758 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SrprbP47758 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrprbP47758 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrprbP47758 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrprbP47758 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms