Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms