Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grik2P39087 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grik2P39087 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Grik2P39087 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Grik2P39087 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grik2P39087 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grik2P39087 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grik2P39087 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Grik2P39087 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms