Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TtlP38585 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TtlP38585 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TtlP38585 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TtlP38585 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TtlP38585 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TtlP38585 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TtlP38585 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TtlP38585 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TtlP38585 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TtlP38585 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TtlP38585 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TtlP38585 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TtlP38585 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TtlP38585 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TtlP38585 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TtlP38585 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TtlP38585 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TtlP38585 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TtlP38585 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TtlP38585 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TtlP38585 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TtlP38585 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TtlP38585 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TtlP38585 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TtlP38585 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TtlP38585 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TtlP38585 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TtlP38585 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TtlP38585 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TtlP38585 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TtlP38585 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TtlP38585 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TtlP38585 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TtlP38585 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TtlP38585 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TtlP38585 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TtlP38585 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TtlP38585 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TtlP38585 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TtlP38585 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TtlP38585 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TtlP38585 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TtlP38585 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TtlP38585 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TtlP38585 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TtlP38585 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TtlP38585 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TtlP38585 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TtlP38585 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TtlP38585 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TtlP38585 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TtlP38585 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TtlP38585 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TtlP38585 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TtlP38585 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TtlP38585 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TtlP38585 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TtlP38585 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TtlP38585 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TtlP38585 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TtlP38585 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TtlP38585 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TtlP38585 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtlP38585 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtlP38585 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtlP38585 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtlP38585 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtlP38585 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtlP38585 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtlP38585 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtlP38585 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtlP38585 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtlP38585 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtlP38585 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtlP38585 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtlP38585 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtlP38585 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtlP38585 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtlP38585 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtlP38585 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtlP38585 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
TtlP38585 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
TtlP38585 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
TtlP38585 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
TtlP38585 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
TtlP38585 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
TtlP38585 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
TtlP38585 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtlP38585 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
TtlP38585 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtlP38585 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtlP38585 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtlP38585 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtlP38585 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtlP38585 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtlP38585 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtlP38585 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtlP38585 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtlP38585 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.6 ms