Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms