Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Hoxc11P31313 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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Hoxc11P31313 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Hoxc11P31313 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Hoxc11P31313 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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