Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Gm29328-212ENSMUST00000209182 1168 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprmP28828 3110083C13Rik-202ENSMUST00000224786 907 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprmP28828 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Gm42133-201ENSMUST00000196076 637 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprmP28828 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprmP28828 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtprmP28828 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gm7061-201ENSMUST00000118127 1416 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Fthl17b-201ENSMUST00000105006 842 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Tomm5-203ENSMUST00000107809 738 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gm14817-201ENSMUST00000148522 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Atp5e-201ENSMUST00000016396 421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gm20610-201ENSMUST00000176406 587 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprmP28828 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Rassf6-205ENSMUST00000202704 1178 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gm36172-201ENSMUST00000219852 723 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprmP28828 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprmP28828 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprmP28828 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Tnnt3-203ENSMUST00000105941 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Tnnt3-204ENSMUST00000105942 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Tnnt3-205ENSMUST00000105943 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Tnnt3-207ENSMUST00000105945 747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Tnnt3-208ENSMUST00000105946 765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Fam220-ps-201ENSMUST00000116535 783 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gm14148-201ENSMUST00000122433 1008 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gm13201-201ENSMUST00000144031 600 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gm16280-201ENSMUST00000162458 623 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Tspy-ps-203ENSMUST00000186546 989 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gm40689-201ENSMUST00000218006 362 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprmP28828 4930458K08Rik-201ENSMUST00000219952 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprmP28828 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms