Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Defa2P28309 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Defa2P28309 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Defa2P28309 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Synpo2-203ENSMUST00000106427 6937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Defa2P28309 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Defa2P28309 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Olfr731-204ENSMUST00000214388 5438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Nup188-201ENSMUST00000064447 5710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Tbcel-203ENSMUST00000125995 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Rreb1-207ENSMUST00000128570 8436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Gm16478-201ENSMUST00000208113 5084 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Defa2P28309 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms