Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd12P23812 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd12P23812 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms