Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkchP23298 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkchP23298 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkchP23298 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkchP23298 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkchP23298 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkchP23298 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkchP23298 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkchP23298 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkchP23298 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkchP23298 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkchP23298 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkchP23298 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms