Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fcer1aP20489 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms