Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms