Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Hoxb1P17919 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms