Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm45584-201ENSMUST00000211586 1143 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm38103-201ENSMUST00000191707 864 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Rps18-201ENSMUST00000008812 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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