Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LtaP09225 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LtaP09225 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
LtaP09225 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LtaP09225 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LtaP09225 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LtaP09225 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
LtaP09225 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LtaP09225 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LtaP09225 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LtaP09225 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
LtaP09225 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
LtaP09225 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LtaP09225 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LtaP09225 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LtaP09225 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LtaP09225 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LtaP09225 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LtaP09225 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LtaP09225 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LtaP09225 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LtaP09225 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LtaP09225 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LtaP09225 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LtaP09225 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LtaP09225 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LtaP09225 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LtaP09225 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LtaP09225 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LtaP09225 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
LtaP09225 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LtaP09225 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LtaP09225 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LtaP09225 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LtaP09225 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LtaP09225 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LtaP09225 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LtaP09225 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LtaP09225 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LtaP09225 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LtaP09225 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LtaP09225 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LtaP09225 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LtaP09225 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LtaP09225 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LtaP09225 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LtaP09225 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LtaP09225 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LtaP09225 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LtaP09225 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LtaP09225 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LtaP09225 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LtaP09225 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LtaP09225 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LtaP09225 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LtaP09225 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LtaP09225 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LtaP09225 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LtaP09225 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LtaP09225 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LtaP09225 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LtaP09225 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LtaP09225 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LtaP09225 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LtaP09225 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LtaP09225 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LtaP09225 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LtaP09225 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LtaP09225 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LtaP09225 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LtaP09225 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LtaP09225 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LtaP09225 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LtaP09225 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LtaP09225 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LtaP09225 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LtaP09225 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LtaP09225 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LtaP09225 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LtaP09225 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LtaP09225 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LtaP09225 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LtaP09225 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LtaP09225 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LtaP09225 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LtaP09225 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LtaP09225 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LtaP09225 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LtaP09225 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LtaP09225 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LtaP09225 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LtaP09225 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LtaP09225 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LtaP09225 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LtaP09225 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LtaP09225 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LtaP09225 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LtaP09225 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LtaP09225 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LtaP09225 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms