Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms