Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BckdkO55028 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
BckdkO55028 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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BckdkO55028 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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BckdkO55028 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BckdkO55028 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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BckdkO55028 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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BckdkO55028 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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BckdkO55028 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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BckdkO55028 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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BckdkO55028 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BckdkO55028 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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BckdkO55028 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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BckdkO55028 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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BckdkO55028 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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BckdkO55028 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
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BckdkO55028 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BckdkO55028 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
BckdkO55028 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
BckdkO55028 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
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