Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

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Length 966 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pkd2O35245 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pkd2O35245 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pkd2O35245 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pkd2O35245 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pkd2O35245 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2O35245 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2O35245 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2O35245 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2O35245 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2O35245 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2O35245 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2O35245 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2O35245 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2O35245 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2O35245 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2O35245 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2O35245 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2O35245 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2O35245 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2O35245 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2O35245 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2O35245 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2O35245 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2O35245 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2O35245 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2O35245 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms