Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sec22bO08547 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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