Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms