Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Gm5225J3QPL3 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Gm5225J3QPL3 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Gm5225J3QPL3 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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