Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms