Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms