Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
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