Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Gm28048F7BCN0 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Gm28048F7BCN0 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Gm28048F7BCN0 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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