Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
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Gm8005F6YKY3 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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