Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Cav2-203ENSMUST00000115462 694 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Gm26626-201ENSMUST00000180989 713 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Junos-202ENSMUST00000125438 559 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Gm29918-201ENSMUST00000205635 138 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms