Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms