Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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