Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clrn2B2RVW2 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clrn2B2RVW2 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms