Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms