Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ssxb8B1AY40 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ssxb8B1AY40 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ssxb8B1AY40 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ssxb8B1AY40 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ssxb8B1AY40 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ssxb8B1AY40 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms