Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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