Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms