Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF3

Skint4, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint4A7TZF3 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Skint4A7TZF3 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Skint4A7TZF3 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Skint4A7TZF3 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Skint4A7TZF3 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Skint4A7TZF3 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Skint4A7TZF3 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Skint4A7TZF3 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Skint4A7TZF3 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Skint4A7TZF3 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Skint4A7TZF3 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Skint4A7TZF3 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Skint4A7TZF3 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Skint4A7TZF3 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Skint4A7TZF3 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Skint4A7TZF3 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Skint4A7TZF3 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Skint4A7TZF3 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Skint4A7TZF3 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Skint4A7TZF3 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Skint4A7TZF3 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Skint4A7TZF3 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Skint4A7TZF3 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Skint4A7TZF3 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Skint4A7TZF3 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Skint4A7TZF3 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Skint4A7TZF3 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Skint4A7TZF3 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Skint4A7TZF3 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Skint4A7TZF3 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Skint4A7TZF3 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Skint4A7TZF3 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Skint4A7TZF3 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Skint4A7TZF3 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Skint4A7TZF3 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Skint4A7TZF3 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Skint4A7TZF3 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Skint4A7TZF3 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Skint4A7TZF3 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Skint4A7TZF3 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Skint4A7TZF3 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Skint4A7TZF3 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Skint4A7TZF3 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Skint4A7TZF3 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Skint4A7TZF3 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Skint4A7TZF3 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Skint4A7TZF3 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Skint4A7TZF3 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Skint4A7TZF3 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Skint4A7TZF3 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms